Netoli mažo kaimelio, esančio Japonijoje, pasirodė gyvi numirėliai. Jie naktimis klajoja po gyvenvietę ir grobia žmones. Drąsus nindzių karys Kioto gavo imperatoriaus įsakymą sunaikinti zombius. Jūs žaidime Ninja Versus Zombie padėsite nindzėms tai padaryti. Prieš jus ekrane bus sritis, kurioje bus jūsų personažas. Valdymo klavišais vadovausite nindzių veiksmams. Jis turės bėgti į priekį per reljefą ir atidžiai apsidairyti. Pakeliui jis galės rinkti auksines monetas ir kitus daiktus, išsibarsčiusius visoje vietoje. Kai tik sutiksite zombį, užpulkite jį. Naudodami įvairius ginklus iš nindzių arsenalo, žaidime Ninja Versus Zombie sunaikinsite zombius ir gausite už tai taškų.