Nors Mario laimėjo"Bowser", jo mylėtojos princesę mieste, prasidėjo potvynis. "Infanta"jau yra visiškai saugi dėl santechniko gelbėtojo, bet dabar pats raštas turi greitai išgelbėti save! Vanduo pasiekia neįtikėtiną greitį ir jau užtvindė žemuma ir pirmuosius pastatų aukštus. Kur vargšas nežino, kaip važiuoti, lieka tik įkopti į dangų kopėčias ir apsižvalgyti ir planuoti išgelbėjimo planą. Mario kontroliuoti Mario veiksmus iš žaidimo Mario Peršokti į savo rankas, kitaip jūsų herojus mirs nesuvokdamas situacijos. Peršokti iš vienos platformos į kitą ir įsitikinti, kad jis nepatenka į baseiną.
