Tikriausiai žinote apie fantomus ar vaiduoklius iš mokslinės fantastikos filmų ir knygų, tačiau žaidimo „Phantom Manor“ herojė, vardu Ashley, turi galimybę pamatyti vaiduoklius, nors tai nutinka ne taip dažnai. Pirmą kartą ji pamatė vaiduoklį, kuris pasirodė tuo metu, kai buvo pavogti mergaitės šeimai priklausę lobiai. Nuo tada jie, kaip nesėkmės persekiotojai, bankrutavo ir buvo priversti persikelti iš savo šeimos turto į nedidelį namą. Herojė nori grįžti į savo buvusią gerovę ir ketina rasti fantomą, ji yra tikra, kad jis kažkaip susijęs. Tačiau už tai ji turės įsiskverbti į savo buvusį dvarą Fantomo dvare.