Senovės laikais Japonijos imperatorių tarnyba buvo nindzės tvarka. Šie paslaptingieji karai tuo metu turėjo geriausius žvalgybos įgūdžius, ir jie buvo visi kovos menininkai. Šiandien, žaidime"Ninja Run", mes padėsime jums vieną tokį karą įsiskverbti į priešo teritoriją. Mūsų herojus važiuoja palei kelią, kuriame yra įvairūs spąstai ir kiti pavojai. Galite daugumoje iš jų peršokti greičiu ir važiuoti. Jei susitiksite su priešo kareiviais, stenkitės juos sunaikinti. Taip pat kelyje rinkti įvairius daiktus, esančius ant žemės. Jie duos jums taškų ir kitų gražių bonusų.