Kai pragariški vartai jau sugebėjo užrakinti, bet blogos dvasios nepaliko vilties išlaisvinti savo kelią, ir po daugelio metų jos pavyko. Šį kartą jie atidarė Marso portalą tikėdamiesi, kad žmonės negalės iš karto jį rasti. Tačiau Marsas jau buvo kolonizuotas, daugelis biologinių laboratorijų nusistovėjo, o daugybė mokslininkų dirbo, visi jie buvo žiauriai atakuoti monstras. Jūsų šlavimo komanda turi sunaikinti 3-ąja Doom monstrus, ir jūs neturite patirti patirties. Eikite į raudoną planetą ir būkite atsargūs, monstrai tapo protingesni ir stipresni.