Sonicas turi galimybę susidoroti su savo senu priešu Knuckles. Mėlynasis ežiukas gavo netikėtos informacijos apie savo priešininko buvimo vietą ir ketina ten vykti. Kartu su savo draugu ir padėjėju Tailsu herojai į salą skris lėktuvu. Nusileidę jie sutiks Knucklesą, bet jis greitai išnyks. Turite padėti Sonicui ir jo draugui persekioti piktadarį. Jis įdėjo daug spąstų saloje, kad niekas jo nepasivytų, tačiau Sonico negalima sustabdyti, o jūs griežtai kontroliuosite herojaus judėjimą, neleisdami jam patekti į aštrius spyglius. Rinkite žiedus, jie visada bus naudingi „Sonic 3 & Knuckles“ herojui.