Virš žemiečių kolonijos, esančios vienoje iš planetų, pasirodė keisti įvairiaspalviai burbuliukai. Kaip paaiškėjo, jie užpildyti nuodais. Palaipsniui jie nusileidžia ant žemiečių kolonijos. Žaidime „Bubble Planets“ teks juos visus sunaikinti. Tam naudosite specialią patranką. Ji šaudys vienkartiniais mokesčiais, taip pat turėdama tam tikrą spalvą. Turėsite atidžiai išnagrinėti visus burbulus ir rasti vietą, kur susitelkę tam tikri objektai. Jie turėtų būti tos pačios spalvos kaip ir jūsų mokestis. Po to paleisite šūvį. Šerdis, pataikiusi į objektų grupę, juos susprogdins ir už tai jums bus suteiktas tam tikras taškų skaičius. Jūsų užduotis yra kuo greičiau išvalyti žaidimo lauką nuo visų burbulų, atlikdami šiuos veiksmus.