Antroje „Virus Ninja 2“ žaidimo dalyje jūs padėsite drąsiam nindzių kariui kovoti su įvairiais virusais. Prieš jus ekrane bus žaidimo laukas, kuriame pasirodys įvairios bakterijos. Jie judės skirtingomis kryptimis ir skirtingu greičiu. Norėdami juos sunaikinti, turėsite naudoti kardą. Atidžiai pažvelkite į ekraną ir braukite objektus pele. Taigi, jūs smogsite bakterijoms ir supjaustysite jas gabalėliais. Kartais tarp šių objektų gali atsirasti bombų. Jūs neturėtumėte jų sukti.