Nindzė nusprendė ištiesti kojas ir bėgioti po miestą rinkdamas monetas. Žaidime „Ninja Runner“ sutiksite herojų ir padėsite jam surengti miesto parkūrą. Herojui neįveikiamų aukštumų nėra, gali kelis kartus spustelėti vaikiną ir jis nušoks į bet kurią viršūnę: platformą, bokštą ir dar vieną viršūnę. Perėję lygį galite pereiti į kitą, tačiau būkite atsargūs, naujuose lygiuose atsiras papildomų kliūčių aštrių spyglių pavidalu, ant kurių nereikės šokinėti, kad neprarastumėte gyvenimo širdžių. Atsiranda vis daugiau aštrių kliūčių, o tai reiškia, kad turėsite būti labai greiti ir judrūs, kad išgelbėtumėte nindzią nuo gyvybių Ninja Runner.